備忘録 as vet.

日々のアイデア、疑問など備忘録的に書きます。Scienceが好きです。

2024-01-01から1年間の記事一覧

<論文感想>心臓外科における赤血球輸血のプロトコル比較RCT: Restrictive VS Liberal

moderate-high risk patientsにおける心臓外科手術後の制限輸血or自由輸血それぞれの28dまでの複合アウトカムの比較をしたRCT Mazer, C. D. et al. Restrictive or Liberal Red-Cell Transfusion for Cardiac Surgery. N. Engl. J. Med. 377, 2133–2144 (201…

<論文感想>濃厚赤血球輸血を実施した犬における臨床スコア、臨床検査の関連性

pRBCを輸血した犬における血液検査・臨床スコアの関連性 Kisielewicz, C., Self, I. & Bell, R. Assessment of Clinical and Laboratory Variables as a Guide to Packed Red Blood Cell Transfusion of Euvolemic Anemic Dogs. J. Vet. Intern. Med. 28, 57…

<論文感想>sparse data biasに対する対処法

Sparse data biasの検出方法と対処方法に関するレビュー Greenland, S., Mansournia, M. A. & Altman, D. G. Sparse data bias: a problem hiding in plain sight. BMJ 352, i1981 (2016). https://www.bmj.com/content/352/bmj.i1981 前回読んだLancetのEdi…

<論文感想>心臓外科患者における輸血リスクの予測は本当に患者を救うのか?

心臓外科における輸血の予測モデルは臨床的に有用かどうか議論したEditorial論文 Bartoszko, J. & Karkouti, K. Can predicting transfusion in cardiac surgery help patients? Br. J. Anaesth. 119, 350–352 (2017). https://doi.org/10.1093/bja/aex216 …

<論文感想>医学研究における統計解析結果の報告方法に関する推奨~Lancetより

医学研究における統計解析結果の報告方法に関する推奨 Mansournia, M. A. & Nazemipour, M. Recommendations for accurate reporting in medical research statistics. Lancet 403, 611–612 (2024). https://doi.org/10.1016/S0140-6736(24)00139-9 Lancetの…

<論文感想>低次元データにおける予測モデル構築のための罰則付きパラメータ推定方法の性能比較

低次元二値アウトカム(アウトカム発生数がパラメータ数より十分多くない状況)の予測モデル構築におけるパラメータ推定法に関する解説と手法の比較 Pavlou, M., Ambler, G., Seaman, S., Iorio, M. D. & Omar, R. Z. Review and evaluation of penalised re…

Rで予測モデルの性能評価(Cross ValidationとBootstrapの比較)

R

予測モデルの性能を評価するときは、データの過学習(Overfitting)を考慮する必要がある。 モデル構築で使用したデータに過剰に最適化され、新規データの予測性能が低下する問題が生じるため。 過学習は予測性能を過剰に見積もるバイアスの原因なので、さま…

Rでサンプルサイズと検出力、SDの関係をシミュレーションしてみた

R

大学院の授業でRを用いたサンプルサイズ(必要症例数)の算出方法のシミュレーションを学んだので、拡張して遊んでみた。 サンプルサイズの求め方はいくつかあるが、一例として α(有意水準)、β(検出力)、SD(標準偏差)、興味のある効果量の差、を決めることで算…

<論文感想>より良い臨床予測モデルを構築するための7 step

prediction model構築の7 stepを解説したチュートリアル論文 Steyerberg, E. W. & Vergouwe, Y. Towards better clinical prediction models: seven steps for development and an ABCD for validation. Eur. Hear. J. 35, 1925–1931 (2014). https://academ…

<論文感想>無兆候MMVD犬に対するACEiの治療効果を評価したsystematic review, meta analysis

無兆候MMVD犬に対するACEiの治療効果を評価したSR/MR Donati, P. et al. Angiotensin-converting enzyme inhibitors in preclinical myxomatous mitral valve disease in dogs: systematic review and meta-analysis. J. Small Anim. Pr. 63, 362–371 (2022)…

<論文感想>心臓外科手術予後予測モデルのパラメータ更新手法に関する検討

心臓外科手術の予後予測モデルの更新手法についての提案論文 Hickey, G. L. et al. Dynamic Prediction Modeling Approaches for Cardiac Surgery. Circ.: Cardiovasc. Qual. Outcomes 6, 649–658 (2018). https://www.ahajournals.org/doi/10.1161/CIRCOUTC…

<論文感想>急性心筋梗塞に対する抗血栓治療後の短期予後予測モデル

大規模RCTデータを用いて急性心筋梗塞に対する抗血栓治療後の30日死亡の予後予測モデルの構築と性能を評価した研究 Lee, K. L. et al. Predictors of 30-Day Mortality in the Era of Reperfusion for Acute Myocardial Infarction: Results From an Interna…